第一，有效市场假说假设投资者的行为都是理性的。这是最受质疑的一条。这一假设认为人们的决策是建立在理性预期、风险厌恶、效用函数最大化以及不断更新决策知识等假设之上。但是大量的数据表明人们的实际投资决策并非如此。比如人们并非总是风险厌恶，反而常常过分相信自己的判断，而且经常借用一些不相关的资讯来买卖证券。 

第二，假设即使有一些非理性的投资者存在，但由于投资者的非理性行为是随机发生的，所以自然而然也就彼此抵消掉了。但是数据表示，非理性投资者的决策并不是完全随机的，他们经常会朝着同一个方向，并不见得会彼此抵消。而且，当这些非理性投资者的行为社会化，相互模仿来进行交易的时候，这种现象会更加明显。 第三，有效市场假说假设认为，即使投资者的非理性行为并非随机而且是具有相关性，但是套利的力量仍然可以让市场恢复效率，也就是在套利和市场竞争的作用下，理性交易者会很迅速地消除非理性交易者引起的价格偏离现象。但行为金融理论认为实践中套利的作用并没有如此有效。套利实际上是受到限制的，因为实践中套利本身具有风险，另一方面，进行套利活动会收到实施成本的影响。